Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ccdc7bE9Q9Y3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ccdc7bE9Q9Y3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ccdc7bE9Q9Y3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ccdc7bE9Q9Y3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ccdc7bE9Q9Y3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ccdc7bE9Q9Y3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ccdc7bE9Q9Y3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ccdc7bE9Q9Y3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ccdc7bE9Q9Y3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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