Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Urb2E9Q7L1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Urb2E9Q7L1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms