Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

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Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Usp31E9Q6Y8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp31E9Q6Y8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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