Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tarbp1E9Q368 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms