Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hectd4E9Q2E4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hectd4E9Q2E4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms