Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ryr1E9PZQ0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms