Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf11E9PZM7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf11E9PZM7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms