Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chd2E9PZM4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chd2E9PZM4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chd2E9PZM4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chd2E9PZM4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd2E9PZM4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms