Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5415E9PXF3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms