Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4931408C20RikE9PWP9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4931408C20RikE9PWP9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4931408C20RikE9PWP9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4931408C20RikE9PWP9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4931408C20RikE9PWP9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4931408C20RikE9PWP9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4931408C20RikE9PWP9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4931408C20RikE9PWP9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
4931408C20RikE9PWP9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4931408C20RikE9PWP9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4931408C20RikE9PWP9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4931408C20RikE9PWP9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms