Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc17E9PVB5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms