Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt2E9PUL5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt2E9PUL5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms