Protein–RNA interactions for Protein: D6MZJ6

Smpd5, MCG22096, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd5D6MZJ6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smpd5D6MZJ6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms