Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh8D3Z6W3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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