Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4D4

1700064H15Rik, RIKEN cDNA 1700064H15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700064H15RikD3Z4D4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700064H15RikD3Z4D4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700064H15RikD3Z4D4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms