Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms