Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Tgfbr3lD3YZZ2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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Tgfbr3lD3YZZ2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Tgfbr3lD3YZZ2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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Tgfbr3lD3YZZ2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Tgfbr3lD3YZZ2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms