Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kif28pD3YXS5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms