Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms