Protein–RNA interactions for Protein: C8YR32

Loxhd1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxhd1C8YR32 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Loxhd1C8YR32 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Loxhd1C8YR32 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms