Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cttnbp2B9EJA2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cttnbp2B9EJA2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms