Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms