Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pnldc1B2RXZ1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms