Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms