Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cped1B2RX70 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms