Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprbB2RU80 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms