Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zscan5bB2RTN3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Zscan5bB2RTN3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms