Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms