Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf518bB2RRE4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms