Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms