Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2012B1B0R1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms