Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scn7aB1AYL1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scn7aB1AYL1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms