Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scml2B1AVB3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms