Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trabd2bB1ATG9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Trabd2bB1ATG9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Trabd2bB1ATG9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Trabd2bB1ATG9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trabd2bB1ATG9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trabd2bB1ATG9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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