Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik3B1AS29 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms