Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms