Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slfn8B1ARD8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn8B1ARD8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms