Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms