Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprsB0V2N1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PtprsB0V2N1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PtprsB0V2N1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprsB0V2N1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprsB0V2N1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprsB0V2N1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprsB0V2N1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprsB0V2N1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprsB0V2N1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprsB0V2N1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprsB0V2N1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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