Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skint4A7TZF3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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