Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp8b5A3FIN4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp8b5A3FIN4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms