Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms