Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf39A2RT81 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf39A2RT81 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms