Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Scn3aA2ASI5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scn3aA2ASI5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms