Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtf1A2AQ19 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtf1A2AQ19 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms