Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Frmpd1A2AKB4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmpd1A2AKB4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms