Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Lcn6A2AJB9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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