Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms