Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc163A2AGD7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc163A2AGD7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms