Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem185aA2AF53 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms